Di rumah Ivan Petrovich Shuisky, di hadapan banyak pendeta dan beberapa bangsawan, mereka memutuskan untuk menceraikan Fyodor Ioannovich dengan tsarina, saudara perempuan Godunova, terima kasih kepada siapa, menurut semua catatan, Boris disimpan. Mereka membuat makalah, di mana, mengingat kemandulan ratu dan masa bayi Demetrius, mereka meminta raja untuk memasuki pernikahan baru. Golovin memberi petunjuk pada Shuisky tentang kemungkinan menempatkan Demetrius sebagai pengganti Fedor, tetapi menerima penolakan keras. Putri Mstislavskaya membawa para tamu berkeliling, meminum kesehatan Fedor. Shakhovsky, pengantin pria Mstislavskaya, mak comblang Volokhov menyebut tempat pertemuan rahasia. Ivan Petrovich mengirimkan petisi ke Metropolitan, meratapi kebutuhan untuk menghancurkan ratu. Fedyuk Starkov, kepala pelayannya, melaporkan apa yang dilihat Godunov. Setelah menerima dari informasi Uglich tentang hubungan Golovin dengan Nagimi dan melihat ancaman terhadap kekuasaannya, ia mengumumkan kepada para pendukungnya, Lup-Kleshnin dan Pangeran Turenin, keputusan untuk berdamai dengan Shuisky. Fyodor datang, mengeluh tentang kuda yang ditabrak. Tsarina Irina muncul, yang oleh Fedor dengan nakal melaporkan tentang kecantikan Mstislavskaya, yang dia lihat di gereja, dan segera meyakinkan Tsarina bahwa dia lebih cantik untuknya daripada orang lain. Godunov berbicara tentang keinginan untuk berdamai dengan Shuisky, dan tsar dengan senang hati menyelesaikan masalah ini.
Fedor mengumumkan niatnya untuk mendamaikan Godunov dengan Shuisky dan meminta bantuan dari Metropolitan Dionysius dan pendeta lainnya. Dionysius menuduh Godunov menindas gereja, toleran terhadap bidat dan melanjutkan pengumpulan pajak dari mana gereja dibebaskan. Godunov memberinya surat perlindungan dan laporan tentang penganiayaan terhadap bid'ah yang dilakukan. Raja meminta dukungan dari Irina dan para bangsawan. Didampingi oleh antusiasme populer, Ivan Petrovich Shuisky datang. Fedor mencela dia karena tidak mengunjungi Duma, Shuisky berkecil hati dengan ketidakmungkinan menyetujui Godunov. Fyodor, mengingat Kitab Suci dan memanggil para pendeta sebagai saksi, berbicara tentang manfaat rekonsiliasi, dan Godunov, yang patuh kepadanya, menawarkan persetujuan Shuisky. Shuisky mencela dia karena tidak ingin berbagi kontrol negara, yang diwariskan John kepada lima bangsawan: Zakharyin (almarhum), Mstislavsky (paksa diikat), Belsky (diasingkan), Godunov dan Shuisky. Godunov, membenarkan dirinya sendiri, berbicara tentang kesombongan Shuisky, bahwa ia menggunakan satu-satunya kekuatan untuk kepentingan Rusia, yang juga dibuktikan dengan; dia menambahkan bahwa tugas sulit untuk menata keadaan frustrasi hanyalah Shuysky. Dan ketika Ivan Petrovich memanggil pendukungnya Metropolitan, dia melaporkan tindakan Godunov yang mendukung gereja dan membujuk Shuisky untuk berdamai. Irina, menunjukkan penutupnya yang dibordir untuk kuil Pskov, mengakui bahwa ini adalah sumpah sumpahnya untuk keselamatan Shuisky, yang pernah dikepung oleh orang Lituania di Pskov. Shuisky yang bersemangat siap untuk melupakan permusuhan lama, tetapi tuntutan dari Godunov menjamin keamanan kepada rekan-rekannya. Godunov bersumpah dan mencium salib. Mereka mengundang yang terpilih dari kerumunan yang dibawa oleh Shuisky. Fyodor berbicara dengan lelaki tua itu dan tidak tahu bagaimana menghentikannya, dalam keponakannya ia mengenali pedagang Krasilnikov, yang menghiburnya baru-baru ini dengan pertarungan beruang, kenang saudara lelakinya, Golub, yang mengalahkan Shakhovsky dengan baku hantam - Godunov dan Shuisky tidak segera berhasil mengembalikan tsar ke tempat yang dipilih oleh para pemilih. . Shuisky mengumumkan rekonsiliasi dengan Godunov, para pedagang khawatir ("Anda mendamaikan kepala kami"), Shuisky kesal dengan ketidakpercayaannya pada orang yang baru saja bersumpah di salib. Pedagang meminta perlindungan dari Godunov, raja, tetapi ia mengirim mereka ke Boris. Boris diam-diam memerintahkan untuk menuliskan nama-nama pedagang.
Pada malam hari di taman Putri Shuisky Mstislavskaya dan Vasilisa Volokhova menunggu Shakhovsky. Dia datang, berbicara tentang cinta, tentang ketidaksabaran yang ditunggu oleh pernikahan, menertawakannya dan bercanda dengannya. Krasilnikov datang berlari, membiarkan Shakhovsky bersembunyi, memanggil Ivan Petrovich dan melaporkan bahwa setiap orang yang bersama tsar ditangkap oleh perintah Godunov. Shuisky yang terkejut memerintahkan Moskow untuk naik ke Godunov. Dia telah mengisyaratkan Dimitri Golovin tiba-tiba putus dan, mengatakan bahwa Boris menipu dirinya sendiri dengan tipuan, dia pergi ke tsar. Para bangsawan yang tersisa, sementara itu, sedang mendiskusikan petisi, mencari ratu baru. Dengan mudah Shuisky memanggil Putri Mstislavskaya. Saudaranya tidak segera memutuskan, ingin menemukan setidaknya alasan untuk bertengkar dengan Shakhovsky. Sementara dia ragu-ragu, Golovin menulis nama sang putri ke dalam petisi. Shakhovskaya muncul, menyatakan bahwa dia tidak akan menyerah pengantin wanita. Sang putri dan Volokhova juga ditemukan. Dengan seruan umum, saling ancaman dan celaan, Shakhovskaya mengambil surat dan melarikan diri. Godunov hadir di surat kabar negara tsar, yang isinya tidak dia masukkan, tetapi setuju dengan keputusan Boris. Tsarina Irina berbicara tentang surat dari Uglich dari Ratu Janda dengan permintaan untuk kembali bersama Dimitri ke Moskow. Fyodor mempercayakan kasus itu kepada Boris, tetapi Irina menuntut solusi "perselingkuhan keluarga" darinya; Fedor berdebat dengan Boris dan kesal dengan kegigihannya. Shuisky datang, mengeluh tentang Godunov. Dia tidak membuka, menjelaskan bahwa para pedagang tidak diambil untuk masa lalu, tetapi karena mencoba untuk mengganggu dunia antara dia dan Shuisky. Tsar siap untuk memaafkan Godunov, percaya bahwa mereka sama sekali tidak mengerti satu sama lain, tetapi permintaan tanpa henti untuk meninggalkan pangeran di Uglich akhirnya marah dengan tsar. Godunov mengatakan bahwa dia memberi jalan kepada Shuisky, Fedor memintanya untuk tinggal, Shuisky, terluka oleh perilaku tsar, pergi. Kleshnin membawa surat Golovin Nagim yang dikirim dari Uglich, Godunov menunjukkannya ke tsar, menuntut Shuisky ditahan dan, mungkin, dieksekusi. Jika gagal, ia mengancam untuk pergi. Fedor yang terkejut setelah ragu-ragu lama menolak layanan Godunov.
Ivan Petrovich Shuisky konsol Putri Mstislavskaya: ia tidak akan mengizinkannya menikahi tsar dan berharap bahwa Shakhovskaya tidak akan memberi tahu mereka. Mengirim kepada sang putri, ia menerima para bangsawan dan para pelarian Krasilnikov dan Dove, dan, dengan asumsi pemindahan Fedor yang miskin dan penobatan Demetrius, mendefinisikan tugas semua orang. Godunov yang terasing, duduk di rumah, bertanya pada Kleshnin tentang Volokhova dan mengulangi berkali-kali, "sehingga dia akan pelacur sang pangeran". Kleshnin mengirim Volokhov ke UGLICH seorang ibu baru, memerintahkannya untuk dilindungi, dan mengisyaratkan bahwa jika pangeran yang menderita padi akan bunuh diri, mereka tidak akan memintanya. Sementara itu, Fedor tidak bisa mengetahui makalah yang disajikan kepadanya. Kleshnin datang dan melaporkan bahwa Boris jatuh sakit karena frustrasi, dan Shuisky harus segera dipenjara karena niatnya untuk mengangkat Demetrius ke atas takhta. Fedor tidak percaya. Shuisky masuk, kepada siapa Fedor berbicara tentang penolakan dan memintanya untuk membenarkan dirinya sendiri. Sang pangeran menolak, sang raja bersikeras, desak Kleshnin. Shuisky mengaku memberontak. Fyodor, takut bahwa Godunov akan menghukum Shuisky karena pengkhianatan, menyatakan bahwa dia sendiri memerintahkan untuk menempatkan sang pangeran di atas takhta, dan memaksa keluar Shuisky yang terkejut dari ruangan. Shakhovskaya menyerbu ke kamar kerajaan dan meminta untuk mengembalikan pengantin wanita kepadanya. Fedor, setelah melihat tanda tangan dari Ivan Petrovich Shuisky, menangis dan tidak mendengarkan argumen Irina tentang absurditas kertas. Melindungi Irina dari penghinaan, dia menandatangani perintah Borisov, menakuti dia dan Shakhovsky. Di jembatan di atas sungai, orang tua itu membuat keributan orang-orang untuk Shuisky, sang hussar menyanyikan tentang keberaniannya. Seorang kurir naik dengan berita tentang kemajuan suku Tatar. Pangeran Turenin dengan pemanah membawa Shuisky ke penjara. Orang-orang, didorong oleh orang tua itu, ingin membebaskan Shuisky, tetapi dia berbicara tentang kesalahannya di hadapan raja "suci" dan bahwa mereka pantas dihukum.
Kleshnin melaporkan kepada Godunov bahwa Shuisky dan pendukungnya dipenjara dan memperkenalkan Vasily Ivanovich Shuisky. Dia membalik masalah ini seolah-olah dia telah memulai petisi untuk kebaikan Godunov. Memahami bahwa Shuisky ada di tangannya, Godunov melepaskannya. Tsarina Irina datang untuk menjadi perantara bagi Ivan Petrovich. Godunov, menyadari bahwa Shuisky tidak akan berhenti berdebat dengannya, bersikeras. Di alun-alun di depan katedral, pengemis berbicara tentang perubahan di kota metropolitan yang keberatan dengan Godunov, tentang eksekusi pedagang yang berdiri di belakang Shuisky. Tsarina Irina memimpin Mstislavskaya untuk meminta Shuisky. Fedor keluar dari katedral, setelah melayani permintaan untuk Tsar Ivan. Sang putri bergegas di kakinya. Fedor mengirim Pangeran Turenin ke Shuisky. Tetapi Turenin melaporkan bahwa Shuisky mencekik dirinya sendiri di malam hari, menyalahkan dirinya sendiri karena mengabaikan (karena ia mengalahkan kerumunan yang dibawa ke penjara oleh Shakhovsky, dan hanya menghajar dengan menembak Shakhovsky). Fedor bergegas ke Turenin, menuduhnya membunuh Shuisky, dan mengancamnya dengan eksekusi. Utusan itu membawa sepucuk surat dari Uglich tentang kematian sang pangeran. Raja yang terkejut ingin mengetahui kebenarannya sendiri. Ada pesan tentang pendekatan Khan dan pengepungan awal Moskow. Godunov menawarkan untuk mengirim Kleshnin dan Vasily Shuisky, dan Fedor yakin akan ketidakbersalahan Godunov. Putri Mstislavskaya mengatakan dia bermaksud untuk memotong rambutnya. Fedor, atas saran istrinya, akan menyerahkan seluruh beban pemerintahan kepada Boris dan, mengingat niatnya untuk "menyetujui segala sesuatu, melicinkan semuanya," meratapi nasib dan tugas kerajaannya.