Maret 1865. Di Amerika Serikat, selama Perang Saudara, lima pemberani-utara melarikan diri dari balon di selatan Richmond. Badai dahsyat melemparkan empat dari mereka ke pantai sebuah pulau tak berpenghuni di belahan bumi selatan. Orang kelima dan anjingnya bersembunyi di laut lepas pantai. Yang kelima ini - Cyres Smith tertentu, seorang insinyur dan ilmuwan berbakat, jiwa dan pemimpin detasemen pelancong - tanpa disadari membuat teman-temannya dalam ketegangan selama beberapa hari, yang tidak dapat menemukan dia atau anjing Top yang dikhususkan untuknya. Mantan budak menderita terutama, dan pelayan Smith yang sekarang setia adalah Negro Nab. Dalam balon itu juga seorang jurnalis perang dan teman Smith, Gideon Spilet, orang yang sangat energik dan tegas dengan pikiran yang mendidih; sailor Pencrof, seorang pemberani yang baik hati dan suka bertualang; Harbert Brown, lima belas tahun, putra kapten kapal tempat Pencroff berlayar, tetap menjadi yatim piatu, dan kepada siapa pelaut memperlakukannya seperti putranya sendiri. Setelah pencarian yang melelahkan, Nab akhirnya menemukan tuan rumahnya yang tak dapat dijelaskan selamat, satu mil dari pantai. Setiap pemukim baru di pulau ini memiliki bakat yang tak tergantikan, dan di bawah kepemimpinan Cyres dan Spilet, orang-orang pemberani ini bersatu dan menjadi tim yang bersatu. Pertama, dengan bantuan sarana paling sederhana yang ada, kemudian memproduksi di pabrik-pabrik kecil mereka sendiri semakin banyak objek tenaga kerja dan barang-barang rumah tangga yang semakin kompleks, para pemukim melengkapi kehidupan mereka. Mereka berburu, mengumpulkan tanaman yang bisa dimakan, tiram, dan bahkan membiakkan hewan domestik dan bertani. Mereka mengatur perumahan untuk diri mereka sendiri yang tinggi di batu, di sebuah gua yang terbebas dari air. Segera, berkat ketekunan dan kecerdasan mereka, para penjajah tidak lagi tahu kebutuhan akan makanan, pakaian, kehangatan dan kenyamanan. Mereka memiliki segalanya kecuali berita tentang tanah air mereka, nasib yang sangat mereka khawatirkan.
Suatu ketika, kembali ke tempat tinggal mereka, yang disebut oleh mereka Istana Granit, mereka melihat bahwa monyet memerintah di dalam. Setelah beberapa waktu, seolah-olah di bawah pengaruh ketakutan gila, monyet-monyet itu mulai melompat keluar dari jendela, dan tangan seseorang melempar tangga tali yang diangkat monyet ke dalam rumah. Di dalam, orang menemukan monyet lain - orangutan, yang mereka pelihara dan mereka sebut Paman Jupe. Di masa depan, Jupe menjadi teman, pelayan, dan penolong yang sangat dibutuhkan orang.
Di hari lain, para pemukim menemukan di dalam pasir sebuah kotak berisi peralatan, senjata api, berbagai peralatan, pakaian, peralatan dapur, dan buku-buku dalam bahasa Inggris. Para pemukim bertanya-tanya dari mana kotak ini bisa berasal. Dari peta, yang juga muncul dalam sebuah kotak, mereka menemukan bahwa di sebelah pulau mereka, pada peta yang tidak ditandai, adalah pulau Tabor. Pelaut Pencrof ingin sekali menemuinya. Dengan bantuan teman-temannya, ia membangun bot. Ketika bot sudah siap, mereka bersama-sama melanjutkannya untuk perjalanan uji coba di sekitar pulau. Selama itu, mereka menemukan botol dengan catatan yang mengatakan bahwa pria yang karam sedang menunggu keselamatan di pulau Tabor. Acara ini memperkuat kepercayaan Pencroff dalam mengunjungi pulau tetangga. Pencrof, jurnalis Gideon Spilet dan Harbert berlayar. Sesampainya di Tabor, mereka menemukan gubuk kecil di mana, dengan semua indikasi, tidak ada yang telah hidup lama. Mereka tersebar di sekitar pulau, tidak berharap untuk melihat orang yang hidup, dan mencoba untuk menemukan setidaknya jenazahnya. Tiba-tiba mereka mendengar Harbert menjerit dan bergegas membantunya. Mereka melihat Harbert bergulat dengan sejenis makhluk dewasa monyet. Namun, monyet itu ternyata adalah manusia liar. Wisatawan mengikatnya dan membawanya ke pulau mereka. Mereka memberinya ruang terpisah di Istana Granit. Berkat perhatian dan kepedulian mereka, orang biadab itu segera kembali menjadi seorang pria yang beradab dan menceritakan kisahnya kepada mereka. Ternyata namanya Ayrton, dia adalah mantan penjahat, dia ingin mengambil alih kapal layar Duncan dan dengan bantuan ampas masyarakat yang sama dia berubah menjadi kapal bajak laut. Namun, rencananya tidak ditakdirkan untuk menjadi kenyataan, dan sebagai hukuman dua belas tahun yang lalu ia ditinggalkan di pulau Tabor yang tidak berpenghuni, sehingga ia akan menyadari perbuatannya dan menebus dosanya. Namun, pemilik "Duncan" Eduard Glenarvan mengatakan bahwa suatu hari nanti dia akan kembali untuk Ayrton. Para pemukim melihat bahwa Ayrton dengan tulus bertobat dari dosa-dosa masa lalunya, dan ia berusaha untuk berguna bagi mereka dalam segala hal. Karena itu, mereka tidak cenderung menghakiminya atas kesalahan masa lalu dan dengan rela menerimanya di masyarakat mereka. Namun, Ayrton membutuhkan waktu, dan karena itu ia meminta kesempatan untuk hidup di karang yang dibangun para pemukim untuk hewan peliharaan mereka yang agak jauh dari Istana Granit.
Ketika bot kembali ke badai dari Pulau Tabor pada malam hari, ia diselamatkan oleh api unggun, yang, seperti yang mereka kira, mereka yang berlayar di atasnya, dinyalakan oleh teman-teman mereka. Namun, ternyata mereka tidak terlibat dalam hal ini. Ternyata Ayrton tidak melempar sebotol uang ke laut. Pemukim tidak dapat menjelaskan peristiwa misterius ini. Mereka semakin cenderung pada gagasan bahwa selain mereka, di pulau Lincoln, ketika mereka membaptisnya, ada orang lain yang hidup, dermawan misterius mereka, yang sering datang membantu mereka dalam situasi yang paling sulit. Mereka bahkan memulai ekspedisi pencarian dengan harapan menemukan tempat tinggalnya. Namun, pencarian berakhir sia-sia.
Musim panas berikutnya (karena sejak saat Ayrton muncul di pulau mereka, dan sebelum dia menceritakan kisahnya, lima bulan telah berlalu dan musim panas berakhir, dan berbahaya untuk berlayar di musim dingin), mereka memutuskan untuk kembali ke Kepulauan Tabor meninggalkan catatan di pondok. Dalam catatan itu, mereka bermaksud memperingatkan Kapten Glenarvan jika dia kembali bahwa Ayrton dan lima korban lainnya sedang menunggu bantuan di pulau tetangga.
Pemukim telah tinggal di pulau mereka selama tiga tahun. Kehidupan mereka, ekonomi mereka mencapai kemakmuran. Mereka sudah memanen tanaman gandum kaya yang tumbuh dari sebutir biji-bijian, yang ditemukan di saku Harbert tiga tahun lalu, membangun pabrik, memelihara unggas, melengkapi tempat tinggal mereka, membuat pakaian hangat baru dan selimut untuk diri mereka sendiri dari wol mouflon. Namun, kehidupan damai mereka dibayangi oleh satu insiden yang mengancam mereka dengan kematian. Suatu ketika, melihat laut, mereka melihat sebuah kapal yang lengkap di kejauhan, tetapi sebuah bendera hitam berkibar di atas kapal. Kapal berlabuh di lepas pantai. Ini menunjukkan senjata jarak jauh yang indah. Ayrton menyelinap ke kapal di bawah penutup malam untuk melakukan pengintaian. Ternyata ada lima puluh perompak di kapal. Ajaibnya menyelinap pergi dari mereka, Ayrton kembali ke pantai dan memberi tahu teman-temannya bahwa mereka perlu bersiap untuk pertempuran. Pagi berikutnya dua perahu turun dari kapal. Pada yang pertama, para pemukim menembak tiga, dan dia kembali, tanah kedua di pantai, dan enam perompak yang tersisa di persembunyiannya di hutan. Meriam hangus dari kapal, dan itu bahkan lebih dekat ke pantai. Tampaknya tidak ada yang memiliki kekuatan untuk menyelamatkan segelintir pemukim. Tiba-tiba gelombang besar melonjak di bawah kapal, dan itu tenggelam. Semua bajak laut di atasnya mati. Ternyata kemudian, kapal itu diledakkan oleh sebuah ranjau, dan peristiwa ini akhirnya meyakinkan penduduk pulau bahwa mereka tidak sendirian di sini.
Pada awalnya, mereka tidak akan memusnahkan para perompak, ingin memberi mereka kesempatan untuk menjalani kehidupan yang damai. Tetapi ternyata perampok tidak mampu melakukan ini. Mereka mulai merampok dan membakar rumah tangga para pendatang. Ayrton pergi ke karang untuk mengunjungi binatang. Perompak menangkapnya dan membawanya ke sebuah gua, di mana mereka ingin menyiksanya untuk setuju pergi ke sisi mereka dengan penyiksaan. Ayrton tidak menyerah. Teman-temannya pergi ke bantuannya, tetapi terluka parah di karang Harbert, dan teman-temannya tetap di dalam dirinya, tidak dapat kembali dengan pemuda yang sedang sekarat. Setelah beberapa hari, mereka masih pergi ke Istana Granit. Sebagai hasil dari transisi, Harbert mulai demam ganas, dia mati. Sekali lagi, takdir campur tangan dalam kehidupan mereka dan tangan teman misterius mereka melemparkan obat yang diperlukan. Harbert pulih sepenuhnya. Para pemukim berniat untuk memberikan pukulan terakhir kepada para perompak. Mereka pergi ke karang, di mana mereka berniat untuk menemukan mereka, tetapi menemukan Ayrton, yang kelelahan dan nyaris tidak hidup, dan di dekatnya, mayat para perampok. Ayrton melaporkan bahwa dia tidak tahu bagaimana dia berakhir di karang, yang membawanya dari gua dan membunuh para perompak. Namun, ia melaporkan satu berita sedih. Seminggu yang lalu, bandit pergi ke laut, tetapi, tidak tahu bagaimana mengendalikan bot, mematahkannya di terumbu pantai. Perjalanan ke Tabor harus ditunda hingga pembangunan kendaraan baru. Selama tujuh bulan berikutnya, orang asing misterius itu tidak membuat dirinya terasa. Sementara itu, gunung berapi terbangun di pulau itu, yang menurut penjajah sudah mati. Mereka sedang membangun kapal besar baru, yang, jika perlu, bisa mengantarkan mereka ke tanah yang dihuni.
Suatu malam, sudah bersiap-siap untuk tidur, penduduk Istana Granit mendengar bel. Telegraf yang mereka habiskan dari karang ke rumah mereka berfungsi. Mereka segera dipanggil ke karang. Di sana mereka menemukan catatan yang meminta mereka untuk ikut serta. Kabel membawa mereka ke sebuah gua besar di mana, yang membuat mereka takjub, mereka melihat kapal selam. Di dalamnya, mereka bertemu dengan tuan mereka dan pelindung mereka, kapten Nemo, pangeran India Dakkar, yang telah berjuang untuk kemerdekaan tanah airnya sepanjang hidupnya. Dia, yang sudah berusia enam puluh tahun yang menguburkan semua rekannya, hampir mati. Nemo memberi teman-teman baru peti mati dengan perhiasan dan memperingatkan bahwa ketika gunung berapi meletus, pulau (seperti strukturnya) akan meledak. Dia meninggal, para pemukim membuka palka kapal dan menurunkannya di bawah air, dan mereka membangun kapal baru tanpa lelah sepanjang hari. Namun, mereka tidak punya waktu untuk menyelesaikannya. Semua kehidupan binasa selama ledakan di pulau itu, yang hanya tersisa sedikit terumbu di lautan. Pemukim, yang menghabiskan malam di tenda di pantai, dibuang ke laut oleh gelombang udara. Semuanya, kecuali Jupe, tetap hidup. Selama lebih dari sepuluh hari mereka duduk di karang, hampir mati kelaparan dan tidak lagi mengharapkan apa pun. Tiba-tiba mereka melihat sebuah kapal. Ini Duncan. Dia menyelamatkan semua orang. Ternyata kemudian, Kapten Nemo, sementara bot itu masih aman, melayang di atasnya ke Tabor dan meninggalkan catatan kepada para penyelamat.
Kembali ke Amerika untuk perhiasan yang disumbangkan oleh Kapten Nemo, teman-teman membeli sebidang tanah luas dan hidup di sana seperti halnya mereka hidup di Pulau Lincoln.